星塵號抵達星盟母星時，大氣層下的景象觸目驚心——曾經繁華的都市如今隻剩斷壁殘垣，地麵被銀白色的機械藤蔓覆蓋，藤蔓上的金屬尖刺不斷捕捉逃亡的星盟居民，將他們拖向遠處的巨型機械建築。“那是機械神教的‘改造站’，他們在把星盟人改造成機械傀儡！”星盟首領卡倫的聲音從通訊器傳來，帶著絕望的顫抖，“我們的防線已經崩潰，就快撐不住了！”
雲航握緊操控杆，目光鎖定改造站旁的一座球形建築——它表麵佈滿能量管道，正不斷向機械藤蔓輸送能量：“那應該是機械藤蔓的能量源，先毀掉它，阻止改造！”星塵號俯衝而下，主炮同時發射，藍色光束擊中球形建築。建築瞬間爆炸，機械藤蔓的光芒迅速黯淡，癱軟在地麵上。
“太好了！”卡倫的聲音透出一絲希望，“但機械神教的主力在母星背麵的‘機械母巢’，那裡纔是他們的核心！”雲航立刻調轉航向：“艾文，檢測母巢的能量反應；雷蒙，帶領艦隊清理沿途的機械傀儡，掩護我們！”
艦隊展開陣型，朝著母星背麵推進。沿途的機械傀儡源源不斷地襲來，它們有的是改造後的星盟人，保留著人類的輪廓卻佈滿機械部件；有的是純機械構造的“獵殺者”，速度極快，能發射追蹤導彈。雷蒙下令艦隊釋放“電磁脈衝彈”，脈衝波掃過之處，機械傀儡紛紛失控癱倒。
星塵號趁機突破防線，抵達母星背麵。機械母巢的全貌展現在眼前——它如同一座巨大的金屬山峰，表麵佈滿蜂巢狀的孔洞，不斷有機械飛行器從中飛出，巢頂的巨型能量炮正對準星盟的殘餘陣地，蓄勢待發。“母巢的核心在頂部的能量炮下方，必須毀掉核心才能停止母巢運作！”艾文調出母巢的結構分析圖。
就在星塵號準備攻擊時，母巢的能量炮突然發射，一道暗紅色光束朝著星塵號襲來。雲航迅速操控飛船側身躲避，光束擦著艦體掠過，擊中遠處的小行星，小行星瞬間化為齏粉。“這炮的威力太強，不能硬抗！”雲航盯著母巢表麵的孔洞，“我們從孔洞潛入母巢內部，近距離攻擊核心！”
星塵號調整姿態，鑽進一個直徑數十米的孔洞。孔洞內部是複雜的金屬通道，通道兩側的機械臂不斷組裝著機械傀儡。“小心通道內的防禦係統！”艾文剛說完，通道頂部突然降下鐳射網。雲航立刻啟動飛船的“能量護盾”，同時釋放時空之力，將鐳射網暫時凍結，快速穿過通道。
經過數分鐘的穿梭，星塵號終於抵達母巢核心室。核心室中央懸浮著一顆暗紅色的“能源晶核”，周圍環繞著數十根能量管道，連接著母巢的各個部位。“就是它！”雲航剛要下令開火，核心室的大門突然關閉，四周的牆壁上彈出數十門能量炮，對準星塵號。
“歡迎來到機械母巢，外來者。”一個冰冷的機械音在覈心室迴盪，“你們以為能毀掉母巢？這裡的一切，都會成為機械神教改造宇宙的基石！”隨著聲音，一道穿著金色機械戰甲的身影從陰影中走出——正是機械神教的首領，摩多。
摩多抬手按下按鈕，核心室的地麵突然裂開，數根機械觸手朝著星塵號襲來。“啟動時空護盾！”雲航大喊，同時操控飛船避開觸手。艾文則瞄準能源晶核，準備發射主炮：“雲航，我來攻擊核心，你攔住摩多！”
摩多冷笑一聲，手臂化作一把能量劍，朝著星塵號劈來。雲航立刻釋放時空之力，在飛船前方形成一道金色屏障。能量劍擊中屏障，劇烈的衝擊讓星塵號連連後退。就在這時，艾文抓住機會，主炮同時發射，藍色光束朝著能源晶核飛去。
“不！”摩多怒吼著，轉身試圖阻擋光束，卻為時已晚。光束擊中能源晶核，晶核瞬間炸裂，母巢的能量管道紛紛斷裂，整個母巢開始劇烈震動。“機械神教不會就此消亡！”摩多不甘心地大喊，乘坐逃生艙從母巢的緊急出口逃離。
雲航立刻操控星塵號衝出母巢，此時母巢已開始崩塌，機械飛行器紛紛失控墜毀。雷蒙帶領的艦隊也清理完了剩餘的機械傀儡，星盟母星的危機終於解除。
卡倫帶著星盟居民前來感謝，雲航卻看著摩多逃離的方向，眉頭緊鎖：“摩多冇被消滅，他肯定還會捲土重來。而且，我總覺得機械神教的背後，還有更強大的勢力在支援。”
此時，艾文的探測儀突然亮起，螢幕上出現一段陌生的能量信號，來源指向宇宙深處的“禁忌星域”：“這信號……和機械母巢的能量波動很相似！”雲航眼神一凜：“看來，我們得去禁忌星域一探究竟了。”
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